全旗共有種子植物878種，分屬345個屬79科。種數最多是菊科，其次是禾本科、豆科、薔薇科等。草場總面積6534萬畝，其中可利用面積達5110萬畝。蘆葦面積為14萬畝，蘊藏量為18萬噸。名貴藥材有黃芪、黃芩、甘草、防風、智因、遠志、赤芍、秦艽等幾十種，食用植物有百合、黃花等，年產量達20萬公斤。天然次生林集中分布于寶格達山地區，面積25萬畝，優勢樹種有白樺，其次有黑樺、山楊，還有較為豐富的山杏林資源。2006年，東烏珠穆沁旗轄5個鎮、2個蘇木：烏里雅斯太鎮、道特淖爾鎮、額吉淖爾鎮、滿都胡寶拉格鎮、嘎達布其鎮和薩麥蘇木、呼熱圖淖爾蘇木。東烏珠穆沁旗地表水源較為豐富，主要分布在東部和南部。最大的內流河是烏拉蓋河，發源于寶格達山西南麓，橫穿烏拉蓋開發區和本旗五個蘇木，全長320公里，流域面積11077平方公里。還有舍野河、那林河等大小河流14條，大小湖泊106個，泉眼64個。地表水總量為12000萬立方米，人均2270立方米。地下水源量為75987立方米／年，可開采量為14577立方米／年。在礦產資源品種上，該旗的資源是品種多，儲量大，品位高，初步探明的主要金屬、非金屬礦產種類有煤、石油、銅、鎢、鋁、巖鹽、水晶、瑪瑙、芒硝、珍珠巖、石灰石等十幾種，其中褐煤和長煙煤儲量達100億噸以上，固體堿2328萬噸，晶體齒鹽102萬噸。廣闊的天然草場上有經濟價值較高的野生動物，沙狙、狐貍、野兔、黃羊、旱獺、狼、大雁、大雞、沙班雞等十幾種，其中旱獺、黃羊和狼為最多。在寶格達山林區還有野豬、駝鹿、雪兔、松雞等飛禽走獸。畜牧業是東烏珠穆沁旗的基礎產業。三十多年來，尤其是實行“草畜雙承包”生產責任后，牲畜頭數居全國牧業旗縣之首。全旗牲畜優良品種最為馳名的是烏珠穆沁肥尾羊和烏珠穆沁白絨山羊。烏珠穆沁馬肉，也是在全國和省區有關部門鑒定中達到了出口肉類標準。畜群中還有從國內外引進的內蒙古細毛羊、北京黑白花牛、三河馬等優良品種。
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