尼木縣居雅魯藏布江中游北岸。山巒起伏，河谷縱橫。地形西高東低，平均海拔4000米以上，境內最高點窮母崗峰，海拔7048米，最低點為瑪曲河匯入雅魯藏布江處，海拔為3700米。

山巒起伏，溝谷縱橫。地形西高東低，平均海拔4000米以上，境內最高窮母崗峰，海拔為7048米，最低點為瑪曲匯入雅魯藏布江處，海拔3700米。

尼木縣屬高原溫帶半干旱季風氣候區，四季分明，夏季雨水集中，輻射強，年日照時數2947.2小時。年無霜期100天左右。年降水量324.2毫米。
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