位于杭州市教工路，1984年從浙江省博物館中獨立出來而建成?，F址主要是一座標本庫房，建筑面積3000余平方米。新建的陳列館于1998年1月對外開放，建筑面積2000余平方米。館內收藏著植物標本、礦物標本、水生生物標本、動物標本和兩棲類標本等近10萬件，其中不乏珍貴標本，如浙江臨海出土的翼龍化石，是全國僅有的幾件比較完整的化石標本之一。此外還有大量國家一類、二類保護動物、植物的標本，有不少還是當年建館時采集而今已經絕種的標本。