卜奎清真寺坐落在繁華商業區----卜奎大街一條深巷里,（卜奎為齊齊哈爾舊稱,因齊齊哈爾又名卜奎，故名。)始建于清康熙二十三年 (1684年)，早于卜奎建城七年，故有“先有清真寺，后有卜奎城”之說。總占地面積6400平方米，建筑面積2000多平方米，是300余年前的舊城內保存較為完整的建筑。從初建時的幾間草房，經過多次修繕、擴建，形成了目前這座省內規模最大、歷史最久、具有中華民族特色的伊斯蘭宗教建筑。 該寺包括東寺、西寺、女寺三部分，過去分別掛牌為東寺、西寺、女寺，1958年合為一寺，1981年定今名。東寺始建于清康熙二十三年（1684年），西寺始建于1852年（咸豐三年），兩寺相鄰，布局相似，均為磚木結構的精美的宮殿式建筑。主體建筑由大殿、拜殿、窯殿、拱廓組成。