扶余歷史悠久，地靈人杰。早在西漢初期，古老的歲貊人便在這里建立了我國東北地區第一個地方民族政權部落國家——夫余國，開創了北疆歷史文化的先河。歷史不斷前進，社會屢經變遷，但扶余作為開啟東北文明的發祥地之一，始終令全國矚目。這里隋屬靺鞨，唐屬渤海；遼時為加強邊防和繁榮邊貿,曾設立寧江州；金太祖反遼誓師和首戰寧江州也源屬此地元隸開元路，明置撒叉河衛（也作三岔河衛）。清初設治以來,曾先后設置副都統衙門、長寧縣、伯都訥廳、新城府。中華民國二年（1913年）改設新城縣，次年為避免重名，以曾為夫余國屬地改稱扶余縣。1945年11月,東北人民自治軍嫩江縱隊長白支隊進駐扶余，次年2月，成立扶余縣人民政府。1987年10月國務院批準撤銷扶余縣。建立扶余市。1992年7月,設立松原市(地級)撤銷扶余市，改稱扶余區，1995年7月恢復設立扶余縣。有史以來,歸屬、分合屢有變化，幅員、疆域有增有減，以至演變成今日之縣域。