貢嘎縣地處雅魯藏布江中游河谷區和江南高山寬谷區。境內高山縱橫起伏，邊綿不斷。地勢西高東低，平均海拔3750米。屬高原帶干旱季風氣候區。日照射間長，氣溫日差較大，年差較小，冬春寒冷多風，雨季降水集中，形成長冬無夏，春秋相邊的氣候特點。年降水量為356.6毫米集中在6-9月份。年日照時數為3194小時。年無霜期142天。常見的自然災害等。風災最為頻繁，年均大風日40天，集中在2-4月。